综合治疗二科是内蒙古自治区脑科医院(第三医院)最早成立的科室之一,多年来一直致力于精神分裂症、双相情感障碍、抑郁症、癫痫所致精神障碍、使用酒精所致精神及行为问题、精神发育迟滞等重性精神疾病的诊疗,具有早期诊断,急性期治疗,恢复期康复的丰富经验,同时采取药物治疗结合中蒙药,以及中蒙医疗术,MECT治疗,重复经颅磁刺激治疗,电磁场治疗,直流电治疗,以及心理治疗等多元化治疗手段,有助于患者回归社会。科室开放床位82张,医护人员27名,其中主任医师2名,副主任医师1名,主治医师4名,住院医师1名,主任护师1名,副主任护师1名,主管护师6名,护师8名,护士2名。科室有单双人病房及三人病房等多种条件的住院病房可供选择,年住院患者500余人次,治愈率高,且一直致力于精神医学的科研教学工作,多人从事内蒙古医科大学的教学工作以及各盟市精神卫生机构的进修及转岗规培教育工作。目前有先进的物理治疗设备:超低频经颅磁刺激治疗仪及电磁场治疗仪等。2021年被医院评为优质护理单元,2023年荣获全国“青年文明号”称号。